2003-2004赛季及之前，季后赛种子排名规则为：排名1-2由2個賽區的榜首球隊以成績排列，而3-8則由其他球隊按排名排列；关于季后赛种子排名规则一直存在着争议。
自2004-2005赛季之起，季后赛种子排名规则为：排名1-3由3個賽區的榜首球隊以成績排列，而4-8則由其他球隊按排名排列。但由於一個賽區的亞軍可能比其餘2個賽區的冠軍成績還要好（即是一個賽區的冠亞軍同時亦是聯盟的冠亞軍）。如果排名1-3由3個賽區的榜首球隊以成績排列，而4-8則由其他球隊按排名排列。那聯盟冠軍便是第1種子，聯盟亞軍便是第4種子。只要兩隊球隊於首輪晉級便會於第二輪對陣。
這個問題於2006年NBA季後賽的西部聯盟出現。聖安東尼奧馬刺(San Antonio Spurs)和達拉斯獨行俠(Dallas Mavericks)皆是西南賽區球隊，亦是聯盟的冠亞軍。他們於第二輪便要對戰。而且西北賽區冠軍丹佛金塊(Denver Nuggets)，成績不及第4、第5、第6、甚至第7種子。但卻位於第3種子的有利位置。最後，NBA便進行賽規改革，確保聯盟中成績最好兩隊於聯盟決賽之前不會對戰。
自2006-2007赛季之起，季后赛种子排名规则为：排名1由最好的榜首球隊获得，排名2-4由2個賽區的榜首球隊和最好的非榜首球隊以成績排列，而5-8則由其他非榜首球隊按排名排列。
2015年6月26日新制上路後，東西區八強將完全按照戰績排名，分組龍頭不再享有優勢。以2014-2015賽季西北組龍頭波特蘭拓荒者(Portland Trail Blazers)為例，在一開始的制度下，他們會是西區第三，現行制度則是第四，而新制則會是第六。這制度對於像西南組這種地獄分組來說是比較公平一些，若以2014-2015賽季成績套用新制，西區前五名會有休士頓火箭(Houston Rockets，第二)、曼非斯灰熊(Memphis Grizzlies，第四)、聖安東尼奧馬刺(第五)等三隊是西南組球隊。
由2020-2021賽季起，新增附加賽賽制，第7種子由第七及第八球隊對決中勝方獲得，第8種子則由第七及第八球隊對決中負方與第九及第十球隊對決中勝方之間爭奪，每場均以單對單一場定勝負形式進行，故第8種子有可能為各區第九甚至更差的第十名，賽季首度應用便已使原本第七及第八球隊，只有於東區的兩隊能同時保住原有的季後賽席位，西區第八的金州勇士(Golden State Warriors)則於附加賽後被淘汰，未能闖進季後賽。2022-23賽季的邁亞密熱火(Miami Heat)，即使成為東南組冠軍，亦只能以東區第七之姿參加附加賽，最終更差點尷尬地成為首支分組龍頭未能闖進季後賽的球隊。2024-25賽季的熱火成為首支分區第十球隊闖進季後賽，他們連續淘汰東區第九的芝加哥公牛和東區第八的阿特蘭大鷹隊。